MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 89726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019897	GCGT	2	8	146	153	0 %	25 %	50 %	25 %	430748350
2	NC_019897	GCT	2	6	180	185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748350
3	NC_019897	ATCGA	2	10	209	218	40 %	20 %	20 %	20 %	430748350
4	NC_019897	AGC	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
5	NC_019897	TGC	2	6	270	275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748350
6	NC_019897	CGA	2	6	349	354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
7	NC_019897	ATC	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748350
8	NC_019897	CATC	2	8	429	436	25 %	25 %	0 %	50 %	430748350
9	NC_019897	TGA	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748350
10	NC_019897	CGA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
11	NC_019897	CGAT	2	8	572	579	25 %	25 %	25 %	25 %	430748350
12	NC_019897	GCC	2	6	594	599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
13	NC_019897	TGCC	2	8	619	626	0 %	25 %	25 %	50 %	430748350
14	NC_019897	GCA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
15	NC_019897	GAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748350
16	NC_019897	GCA	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
17	NC_019897	TGC	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748350
18	NC_019897	CG	3	6	846	851	0 %	0 %	50 %	50 %	430748350
19	NC_019897	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
20	NC_019897	CTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748350
21	NC_019897	CG	3	6	910	915	0 %	0 %	50 %	50 %	430748350
22	NC_019897	CGC	3	9	948	956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
23	NC_019897	CCGCT	2	10	1054	1063	0 %	20 %	20 %	60 %	430748350
24	NC_019897	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
25	NC_019897	GGC	2	6	1156	1161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
26	NC_019897	CGG	2	6	1173	1178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
27	NC_019897	CAG	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
28	NC_019897	CAG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
29	NC_019897	TGA	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748350
30	NC_019897	CAG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
31	NC_019897	AGC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
32	NC_019897	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
33	NC_019897	CCG	2	6	1503	1508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
34	NC_019897	CAG	3	9	1513	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748350
35	NC_019897	CCGG	2	8	1522	1529	0 %	0 %	50 %	50 %	430748350
36	NC_019897	GCG	2	6	1532	1537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
37	NC_019897	CGC	2	6	1561	1566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
38	NC_019897	CCGG	2	8	1648	1655	0 %	0 %	50 %	50 %	430748350
39	NC_019897	TCC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748350
40	NC_019897	CGC	2	6	1680	1685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
41	NC_019897	TCC	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748350
42	NC_019897	GTAT	2	8	1750	1757	25 %	50 %	25 %	0 %	430748350
43	NC_019897	CCG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
44	NC_019897	CGTC	2	8	1818	1825	0 %	25 %	25 %	50 %	430748350
45	NC_019897	CGC	2	6	1896	1901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
46	NC_019897	CTTC	2	8	1929	1936	0 %	50 %	0 %	50 %	430748350
47	NC_019897	GAT	2	6	1946	1951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748350
48	NC_019897	TCCG	2	8	1972	1979	0 %	25 %	25 %	50 %	430748350
49	NC_019897	TTC	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748350
50	NC_019897	CTT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748350
51	NC_019897	CGG	2	6	2070	2075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
52	NC_019897	GGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
53	NC_019897	GCG	2	6	2144	2149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
54	NC_019897	CCG	3	9	2151	2159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748350
55	NC_019897	GTTTCT	2	12	2193	2204	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	430748350
56	NC_019897	GACA	2	8	2221	2228	50 %	0 %	25 %	25 %	430748350
57	NC_019897	GTC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748350
58	NC_019897	GCG	2	6	2252	2257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748350
59	NC_019897	CCG	2	6	2485	2490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
60	NC_019897	A	6	6	2493	2498	100 %	0 %	0 %	0 %	430748351
61	NC_019897	GAC	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748351
62	NC_019897	TCG	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748351
63	NC_019897	ACG	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748351
64	NC_019897	GCG	2	6	2791	2796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
65	NC_019897	CGC	2	6	2833	2838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
66	NC_019897	CGAC	2	8	2884	2891	25 %	0 %	25 %	50 %	430748351
67	NC_019897	ACG	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748351
68	NC_019897	ACA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748351
69	NC_019897	ATC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748351
70	NC_019897	CAT	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748351
71	NC_019897	GGCGC	2	10	2980	2989	0 %	0 %	60 %	40 %	430748351
72	NC_019897	CGA	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748351
73	NC_019897	GC	3	6	3061	3066	0 %	0 %	50 %	50 %	430748351
74	NC_019897	GGC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
75	NC_019897	CGG	2	6	3086	3091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
76	NC_019897	CGC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
77	NC_019897	CGC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
78	NC_019897	GCCG	2	8	3233	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	430748351
79	NC_019897	CATCT	2	10	3282	3291	20 %	40 %	0 %	40 %	430748351
80	NC_019897	GGC	2	6	3300	3305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
81	NC_019897	CAT	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748351
82	NC_019897	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
83	NC_019897	GAA	2	6	3417	3422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748351
84	NC_019897	CGGATC	2	12	3423	3434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748351
85	NC_019897	ACA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748351
86	NC_019897	ATC	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748351
87	NC_019897	GAG	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748351
88	NC_019897	CGG	2	6	3554	3559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
89	NC_019897	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748351
90	NC_019897	GCC	2	6	3672	3677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748351
91	NC_019897	ATC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748352
92	NC_019897	GC	3	6	3768	3773	0 %	0 %	50 %	50 %	430748352
93	NC_019897	CGG	2	6	3821	3826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
94	NC_019897	CCG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
95	NC_019897	GCC	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
96	NC_019897	CGT	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748352
97	NC_019897	CTT	2	6	3975	3980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748352
98	NC_019897	TTCG	2	8	4017	4024	0 %	50 %	25 %	25 %	430748352
99	NC_019897	CGCGG	2	10	4065	4074	0 %	0 %	60 %	40 %	430748352
100	NC_019897	CGG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
101	NC_019897	GAT	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748352
102	NC_019897	GCC	2	6	4178	4183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
103	NC_019897	GAG	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748352
104	NC_019897	CGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
105	NC_019897	GCC	2	6	4266	4271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
106	NC_019897	CGC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
107	NC_019897	GTCCG	2	10	4296	4305	0 %	20 %	40 %	40 %	430748352
108	NC_019897	GGC	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
109	NC_019897	CTC	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748352
110	NC_019897	CGT	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748352
111	NC_019897	GCG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
112	NC_019897	ATC	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748352
113	NC_019897	GCC	2	6	4542	4547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
114	NC_019897	ATC	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748352
115	NC_019897	CG	4	8	4640	4647	0 %	0 %	50 %	50 %	430748352
116	NC_019897	GCCGA	2	10	4669	4678	20 %	0 %	40 %	40 %	430748352
117	NC_019897	AGATC	2	10	4685	4694	40 %	20 %	20 %	20 %	430748352
118	NC_019897	CGG	3	9	4718	4726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
119	NC_019897	TCC	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748352
120	NC_019897	CGG	2	6	4862	4867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
121	NC_019897	GTCC	2	8	4898	4905	0 %	25 %	25 %	50 %	430748352
122	NC_019897	CGC	2	6	4983	4988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
123	NC_019897	GC	3	6	5024	5029	0 %	0 %	50 %	50 %	430748352
124	NC_019897	CGA	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748352
125	NC_019897	TTG	2	6	5086	5091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748352
126	NC_019897	CG	3	6	5145	5150	0 %	0 %	50 %	50 %	430748352
127	NC_019897	CGT	3	9	5205	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748352
128	NC_019897	GAC	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748352
129	NC_019897	TTC	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748352
130	NC_019897	GTT	2	6	5268	5273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748352
131	NC_019897	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748352
132	NC_019897	GCC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748352
133	NC_019897	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748352
134	NC_019897	CG	3	6	5647	5652	0 %	0 %	50 %	50 %	430748353
135	NC_019897	CTC	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748353
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259	NC_019897	GGAT	2	8	11853	11860	25 %	25 %	50 %	0 %	430748359
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387	NC_019897	CGGC	2	8	17864	17871	0 %	0 %	50 %	50 %	430748361
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499	NC_019897	GCT	2	6	22403	22408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748364
500	NC_019897	CGTC	2	8	23147	23154	0 %	25 %	25 %	50 %	430748365

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